Полезные ресурсы

Глубокоуважаемые коллеги!
Наиболее полное собрание ссылок и описаний программного обеспечения для кристаллографических расчетов (включая анализ дифракционных данных) содержится на сайте Международного Союза Кристаллографов (International Union of Crystallography) по адресу http://www.iucr.org/resources/other-directories/software. Здесь мы приведем лишь некоторые ссылки на бесплатные программы, которыми сами пользуемся и будем представлять Вашему вниманию наши методические обзоры, методики исследований и инструкции.

Выберите интересующий раздел:

Презентации

Базы данных и справочники

Программы для рентгенофазового анализа и исследования микроструктуры вещества

PowDLL - конвертер различных форматов файлов порошковых дифракционных данных. Поддерживает множество, но не все важные форматы. http://users.uoi.gr/nkourkou/powdll.htm

ССР14 - коллекция полезных программ от международного вычислительно проекта для индицирования порошковых рентгенограмм. http://www.ccp14.ac.uk/solution/indexing/

UnitCell - программное обеспечение для уточнения параметров элементарной ячейки вещества по индицированным порошковым дифракционным данным. http://www.ccp14.ac.uk/ccp/web-mirrors/crush/astaff/holland/UnitCell.html

Powder Cell - программное обеспечение для полнопрофильного анализа порошковых дифракционных данных методом Ритвельда (моделирование порошковых рентгенограмм по структурным данным, визуализация и уточнение кристаллических структур, количественный анализ смесей, определение размеров кристаллитов и микронапряжений методом Вильямсона-Холла). http://www.ccp14.ac.uk/tutorial/powdcell/

Maud - программное обеспечение для полнопрофильного анализа порошковых дифракционных данных методом Ритвельда со множеством дополнительных возможностей. http://www.ing.unitn.it/~maud/

WinFit - программное обеспечение для микроструктурного анализа методом Уоррена-Авербаха. http://www.ccp14.ac.uk/ccp/web-mirrors/krumm/html/software/winfit/winfitnews.html

Fityk - Программное обеспечение для нелинейного фитинга. http://fityk.nieto.pl/

Программы для рентгеноструктурного анализа

SHELX - комплекс программ для решения и уточнения кристаллической структуры по данным монокристальной рентгенографии. Первая версия программы была написана еще в конце 1960-х британским кристаллографом Джорджем Шелдриком, в настоящее время работающим в Геттингемском университете (Германия), и с тех пор является одной из наиболее популярных в мире программ в области расшифровки структур. Для работы в программе необходимы файл с расширением .hkl, содержащий интенсивности дифракционных максимумов, полученных от кристалла, и файл с расширением .ins, содержащий данные о кристалле (параметры элементарной ячейки, пространственную группу, примерный химический состав). http://shelx.uni-ac.gwdg.de/SHELX/index.html

Sir - широко распространенный пакет для решения и уточнения небольших монокристаллических структур с использованием данных рентгеновской дифракции или дифракции электронов. Пакет программ Sir (Semi-Invariants Representation) был первоначально разработан для неэмпирического решения кристаллических структур прямыми методами. Современная версия, доступная как самостоятельная программа или включенная в пакет Il Milione, предназначена для неэмпирического решения структур различного размера и сложности, вплоть до макромолекул, при условии, что разрешение данных не ниже 2.0 Å. http://wwwba.ic.cnr.it/content/sir2011-v10-available

WinGX - программный комплекс под управлением ОС Windows для решения, уточнения и анализа данных рентгеновской дифракции на монокристаллах для малых молекул. Комплекс предоставляет унифицированный и удобный графический интерфейс для наиболее распространенных и популярных кристаллографических программ, таких как SHELX-97 и SirWare (SIR-97, SIR-2004). http://www.chem.gla.ac.uk/~louis/software/wingx/

Olex2 - простая в использовании программа для решения и уточнения кристаллических структур малых молекул. Она включает в себя множество полезных инструментов для структурного анализа, архивирования и создания отчетов. В оболочку комплекса могут интегрироваться программы SHELX. В таком виде комплекс сочетает в себе не только надежность и достоверность данных, обусловленные использованием программы Дж. Шелдрика, но также достоинства непосредственного отображения данных уточнения структуры, что значительно облегчает работу с органическими и металлоорганическими соединениями. http://www.olex2.org/

Platon - совместимая с SHELX кристаллографическая программа, позволяющая проводить автоматизированный расчет производных геометрических данных (длины связей, углы, торсионные углы, анализ координационных сфер, водородных связей и других межмолекулярных взаимодействий и т. п.), а также используется для проверки выбранной пространственной группы и преобразований элементарных ячеек. http://www.chem.gla.ac.uk/~louis/software/platon/

Mercury - программа для визуализации кристаллических структур. Позволяет проводить анализ межатомных расстояний, геометрии химических связей, способов упаковки молекул, а также проводит расчет теоретической порошкограммы по структурным данным. http://www.ccdc.cam.ac.uk/products/mercury/